Бактерия-некроморф на протяжении долгого времени (возможно, миллионов лет) не существовала в природе. Её РНК восстановили, считывая информацию с покрывающих «Маркер» надписей, биологи колонии на Эгиде-7. Известно, что существует чёрный маркер, найденный на земле за 200 лет до фактических событий, основоположником юнитологической религии Олтманом. Впрочем, религией это течение стало не сразу, поначалу оно представляло собой религиозную секту, которая сводила воедино науку и религию. Олтман же, обнаружив маркер, выдвинул гипотезу создания жизни на земле благодаря действию обелиска, в свою очередь оставленного на земле пришельцами, чей уровень научно-технического развития несопоставим. Эта гипотеза вызвала массу споров, Олтман погиб при загадочных обстоятельствах, что послужило толчком к развитию юнитологической церкви, а правительство, максимально секретно, производило исследования обелиска, итогом стало создание абсолютной копии чёрного маркера, единственное отличие — цвет, красный. Тогда и была образована первая колония на Эгиде-7, которая также была инфицирована и истреблена, но тогда удалось запечатать бактерии под обелиском, который имеет свойство сдерживать размножение и распространение. Когда обелиск был извлечен и отправлен на борт «Ишимуры», бактерии вырвались на свободу.
Внешне игра напоминает Resident Evil 4. Камера «прыгает» за плечо персонажа при прицеливании, но местная боевая система опирается на технологические достижения последнего года. В игре есть зоны с отсутствующей гравитацией, атмосферой (в это время глушится звук). У игры нет графического интерфейса: состояние здоровья героя определяется с помощью шкалы на его спине, а количество патронов считывается с оружия при прицеливании. Также здесь практически нет заставок — все кат-сцены интерактивны. Помимо этого присутствуют верстаки и «магазины», в которых можно улучшать и закупать снаряжение. По ходу игры из поверженных противников будут выпадать кредиты и ценные вещи, которые можно продать в «магазине».